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１、拿到色譜柱后先閱讀說明書，了解色譜柱的具體性能：耐受溫度、耐受ＰＨ等。以及色譜柱的沖洗和保存條件。經過柱校測試確認色譜柱本身沒有問題后方可正常使用。
２、樣品充分前處理，確保樣品的潔凈；使用保護柱或在線過濾器，根據實際情況更換保護柱芯或濾片。
３、避免壓力和溫度的急劇變化及任何機械震動。
４、應逐漸改變溶劑的組成，特別是反相色譜中如果流動相中使用了緩沖鹽，避免出現鹽析。
５、選擇使用適宜的流動相（尤其是PH），以避免固定相被破壞，PH過低共價鍵斷裂，鍵和相水解；PH過高硅膠溶解。
６、色譜柱使用過程中，如果壓力升高，或出現污染，選擇適當的條件沖洗或反沖。
適用于C18、C8、C4、C1、苯基、PFP、AQ等
使用至少20倍柱體積的含有≥30%誰的極性郵寄溶劑（如乙腈）作為流動相除去柱子中的緩沖鹽；使用至少20倍柱體積的含有95%極性郵寄溶劑（如乙腈）沖洗色譜柱。
污染物的去除常規星期后柱校沒有明顯恢復時，使用50%異丙醇／乙腈以低流速清洗20倍柱體積以除去污染物。（以上操作可根據實驗室自身SOP視情況而定，此方法僅為賽分針對自己品牌的反相色譜柱沖洗的參考意見）
適用于氨基柱、氰基柱
常規清洗：乙腈：水＝60:40條件對色譜柱進行沖洗，清洗時不建議水相比例超過40%，過高使用水相容易導致鍵和相水解。
色譜柱再生：當色譜柱經過長期使用，柱校降低時，可以對色譜柱進行再生，乙腈：水（水中加入0.05%氨水）＝60:40條件沖洗30倍柱體積。（以上操作可根據實驗室自身SOP視情況而定，此方法僅為賽分針對自己品牌的色譜柱沖洗的參考意見）
適用于離子交換柱SCX、SAX沖洗方法
日常沖洗：用****水沖洗30個柱體積除鹽，然后用20%甲醇或乙腈沖洗20個柱體積后保存在20%甲醇或乙腈中。
長期保存：用****水沖洗30個柱體積去除鹽，然后用50%乙腈；50%水沖洗20個柱體積后保存在50%乙腈：50%水中。
再生：先用高濃度的緩沖鹽（不超過１Ｍ），然后再用****水洗，****乙腈或甲醇沖洗，再用20%乙腈或甲醇保存。（以上操作可根據實驗室自身SOP視情況而定，此方法僅為賽分針對自己品牌的色譜柱沖洗的參考意見）
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